
JohanniskircheDie Reformation brachte dann einige Veränderungen mit sich, da das Kloster säkularisiert wurde. Das Patronat über diese Kirche bekam die Stadt Neubrandenburg verliehen. Der Chorraum diente lange Zeit als Speicher, bis er aufgrund von starker Baufälligkeit im 19. Jahrhundert zusammenfiel. In den Jahren von 1890 bis 1894 wurde die Kirche gründlich restauriert und der ehemalige Chorraum in seiner ursprünglichen Form nicht wiederaufgebaut. sondern abgerissen, da es auch aufgrund einer Straßenverbreiterung notwendig wurde.
Die sehenswertesten Einrichtungsgegenstände sind die aus dem Jahre 1598 stammende und aus Kalkstein gefertigte Kanzel im Stil der Renaissance und der um das Jahr 1730 entstandene barocke Altar, welcher mit reichlichen Ornamenten geschmückt ist. Das Chorgestühl der Kirche stammt aus der Zeit der Reformation. Auf diesen Bänken fanden in Neubrandenburg die Friedensgebete statt, welche in der DR schließlich zu dem friedlichen Demonstrationen mündeten, welche die politische Wende in Ostdeutschland einläuteten. Heutzutage finden in der Johanniskirche regelmäßig Konzerte mit Chören und Orgelmusik statt, welche sich einer großen Beliebtheit erfreuen.